Фонд «Мой Байкал» собирает средства на уставную деятельность организации. Эти деньги фонд может распределить на необходимые для него траты, что станет важной подушкой безопасности в его работе. Это может быть закупка канцелярии или оборудования, аренда офиса, заработная плата юристов или координаторов программ и многое другое. Уставная деятельность включает в себя как работу целевых программ фонда, так и покрытие административных расходов, которые однако не могут превышать 20% от нецелевых пожертвований НКО за год. За все средства, собранные на уставную деятельность в этом проекте, фонд отчитается в течение года со дня завершения проекта.